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代谢组学服务FAQ:

人阅读 发布时间:2014-03-03 13:09


客户:我们需要怎么处理样本再送给你们检测呢?

回答:一般客户只需要提供新鲜样本,不需要做样本代谢物的提取,此步骤由我公司完成。采样常规方式:新鲜样本过液氮30分钟后,转移至-80度冰箱,可以长期保存,但建议不要超过12个月。对于尿液,粪便,肠道内容物等样本,建议添加叠氮化钠后保存。

客户:样本我怎么给你们呢?

回答:一般采用干冰运送的方式,即准备大泡沫盒一个,将放入足量干冰,将样本整理好后埋入其中并封好。干冰在相对密闭的泡沫盒中,一般冬天每天挥发4KG,夏天每天挥发5KG,根据寄往上海实验室的时间不同,自行准备好足量的干冰快递寄送即可。也可以采用冷链运输,该类公司专门提供低温样本运输服务,例如敏风,捷顺祥等,但价格较贵。

客户:实验做完了,但是我们写文章的时候需要把实验步骤也写进去,但实验是你们做的,能提供相关信息吗?

回答:每个实验,我们一般都会向客户提供三份资料:
1.实验原始数据:离子流图(或核磁共振谱图),每个样本检出的所有物质的表格(single表)
2.实验报告:包括样本处理和上机的步骤流程(中英文对照)
3.数据分析报告:根据签订合同内容,做相对应的数据分析,不同的数据分析内容,收费有差异。

客户:我是第一次做代谢组学,如果在你们那边做了,也出了数据报告,但是我不一定看得懂,那怎么办呢?   

回答:首先我们的实验报告,都有一页是file explanation,里面对数据分析结果中的每一个参数都有说明,如果您还是看不懂,或者理解不了,可以联系负责您这个项目的销售人员,他们会帮您解释的,我们每个销售人员都有可以咨询的技术人员。其次,我们这边还有不定期举行代谢组学数据分析培训班,由工作在一线的数据分析老师进行讲解,您可以对自己的实验报告如何做出来的,每个参数的意义有详细的了解。

客户:如果我决定在你们这边做实验和数据分析,那么具体怎么操作呢?

回答:一般来说,做项目都是需要签订服务合同的,在我们销售人员拟好合同,客户看过电子版确认后,销售人员会把合同打印出来寄给客户,由客户方面签字盖章后,寄回一份。同时客户需要把检测的样本寄送到我公司实验室,并附上填写完整的样本登记单。之后按照合同支付预付款,在支付预付款3个工作日之前,我们会将合法足额的上海市国税机打发票寄送到您的手中,在支付完预付款后,我公司会在合同签订日期内完成项目,并将报告发送到客户手中,客户验收完毕后,在10个工作日内将尾款打入我公司指定账户。客户还享有6个月内,一次免费数据分析修回。

客户:我在你们这边做了实验之后发文章,如果编辑argue我的数据的话,怎么办?

回答:只要是关于我公司提供的数据报告的argument,我们都会负责解释,并提供相应的材料和支持论文,这个您不用担心。但是如果是质疑您的实验设计或生物学意义方面,可能需要您自己来解释了,我们只能提供一些意见和建议。

客户:我把样本拿给你们后,大概多久我能拿到结果?

回答:代谢组学三个平台时间略有差异,做核磁共振和GC-TOF-MS的话,一般来说10周内可以完成,LC-MS的话需要12周左右。如果您对实验完成时间要求特别紧的话,请和我们的销售人员沟通,根据情况,会加收部分加急的费用(5%-20%)。

客户:据我了解代谢组学有3大类平台,分别是核磁共振仪(NMR),气相色谱质谱联用仪(GC-MS)和液相色谱质谱联用仪(LC-MS),那如何选取其中一个来做呢?

回答:就大致来讲,因为核磁共振是通过解谱对物质进行定性的,相对而言,准确度会高一些,但同时它的灵敏度是三个平台中最低的,一般来说大多数种类的样本,能检测到30-100种物质。(见过日本有报道,能用600M的核磁单次检测到200种左右的物质)GC-MS的灵敏和分离效率都是不错的,能够检测到的物质也较多(我公司一般人血清样本可以检测出400-500种左右的物质,人尿液样本能够检测出500-700种物质)并且定性情况也不错,但是由于GC-MS是升温气化后检测样本,即使现在通过衍生化后能够检测到的物质的分子量一般不超过2000,都是属于小分子代谢物。LC-MS无论是分离效率和灵敏度都很不错,虽然也有一定的偏向性,但是能检测物质种类仍然较多的,它最大的缺点在于没有专门做代谢组学的数据库可供参考,对物质搜库定性带来很大难度。

客户:在你们那边做课题的话,我最不放心的是,我现在没办法知道我最后的结果会是什么样的,我怕你们做的分析报告和文献中常见的数据分析图表差异较大,发文章用不上,这个怎么办呢?

回答:这一点,其实从一开始我们就考虑到了,在合同签订前,我们交流的过程中,我们这边的工作人员会记录您的详细实验信息,公司这边会根据您的项目情况,出一个实验方案(不收费的),实验方案内容包括:您的实验分组,样本数量,需要如何进行数据分析,数据分析内容展示示意图(您最后得到的结果就是以该形式呈现的),核算实验费用,该项目完成所需要的时间等信息,拿到该实验方案后,您可以清晰看到上述所有内容,也方便您打印出来,和课题组内的其他老师商量,或者向导师汇报。

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