干货分享丨代谢组学三个常用网站使用介绍

话不多说，直接进入使用实操主题~
手头有一些关注或挑选到的重要差异代谢物质，该如何针对这些物质寻求相关的代谢通路信息呢？

分析网站链接：https://www.kegg.jp/kegg/tool/map_pathway2.html

首先，进行网站，导入下图箭头所指相关案例数据
 
上图箭头所指选取了网站默认提供的Homo sapience pathway数据。小编提醒，这里输入的代谢物质或基因名称格式应为网站对应K/C开头的编号。
 
接下来，鼠标左键点击选中相应Exec即可，不要太方便呀~
 
从返回的结果中，可以看到生成的代谢通路数量总共11条，同时，每条通路的显示形式为通路编号+代谢通路名称，通路后面小括号里的数字表示当前通路的差异物质/基因数目，如果想要具体知晓哪些物质/基因，则只需点击“Show matched objects”，如下图所示：
接下来，还可对每一条生成的代谢通路进行理解分析，以Biosynthesis of amino acids为例，鼠标左键点击该通路信息，则有
 
进一步，点击当前代谢通路图上方对应的Help按钮，可帮助我们针对通路的形成做具体的了解掌握。最后，通过 Image (png) file对通路分析结果图形进行本地下载保存，可千万别忘了哦~

Tips：如果要综合多条代谢通路分析的结果，咋办？这里小编推荐一个合并的参考方法，针对那些同时参与多条通路分析的代谢物质，可将它们作为通路间连接合并的桥梁~
如何快速方便的找到物质对应的一些常见数据库索引号呢，例如上面提到的kegg通路分析所需的KEGG ID号（以C开头的）？

分析网站一链接：https://www.metaboanalyst.ca/MetaboAnalyst/upload/ConvertView.xhtml

以网站提供的代谢物名称为例，这里需要注意的是如果物质名称带有古希腊字母信息，类似α、β等需分别用alpha、beta等进行替换。
接下来，选择对应的输入类型为“Common Name”，点击Submit，进行结果匹配： 在生成的结果匹配表里，可以看到每个输入物质对应的HMDB、KEGG等数据库编号。同时，针对有黄色标记的模糊匹配到的物质结果，可进一步点击Details栏对应的View进行候选结果查看。 最后，可点击上图的here链接进行匹配表格结果的保存下载。

当然，如果想要批量获取得到物质对应的CAS/ InChIKey等编号，该怎么办呢？

分析网站二链接：http://cts.fiehnlab.ucdavis.edu/batch

进入网站，左侧输入上面转换得到的KEGG ID号，在右侧分别选择CAS和InChIKey两种生成的编号信息，见下图：
选择好后，点击Convert，则
 
最后，生成的匹配表格进行保存本地下载。
 
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