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技术资料 | 代谢流-高分文章新策略专刊
人阅读 发布时间:2021-01-18 11:24
代谢网络是复杂并且动态变化的,而代谢组学仅能提供静态的代谢物丰度信息,因此仍存在局限性。代谢流分析技术则可以很好地弥补这一局限。
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为了深入了解细胞代谢过程,我们采用各种组学工具包括基因组学、宏基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学进行分析。但由于这些组学技术目前无法充分反映转录后调控、酶活性及细胞过程,于是提出了代谢流组学(Fluxomics)来全面研究所有代谢物的流率(flux rates),这样就可以很好的描述细胞在生理过程中的代谢活性。
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稳定同位素追踪代谢流通过计算代谢物反应速率真实客观的反应机体代谢状态,挖掘被传统静态代谢组学掩盖的真实代谢速率。是许多CNS顶刊杂志的新宠,俨然已经成为肿瘤和免疫研究领域的标准配置。如下表格整理了部分代谢流文献供参考。
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BIOTREE能量代谢之靶标代谢流解决方案:主要集中在能量代谢明星通路精细化代谢速率研究,包含糖酵解途径、三羧酸循环、磷酸戊糖途径。
糖酵解途径(EMP)是指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的阶段,是体内糖代谢最主要途径。此途径在动植物和许多微生物中普遍存在。在需氧生物中,糖酵解途径是葡萄糖氧化生成二氧化碳和水的前奏。糖酵解生成的丙酮酸可进入线粒体,通过三羧酸循环(TCA)及电子传递链彻底氧化成二氧化碳和水,并生成腺嘌呤核苷三磷酸。
三羧酸循环是(TCA)需氧生物体内普遍存在的代谢途径,是生物机体获取能量的主要方式,是糖、脂肪和蛋白质三种主要有机物在体内彻底氧化的共同代谢途径,是体内三种主要有机物互变的中心枢纽。
磷酸戊糖途径(PPP)是葡萄糖氧化分解的一种方式,在动物、植物和微生物中普遍存在。在生物体内磷酸戊糖途径(PPP)除了提供能量外,主要是为合成代谢提供多种原料。如为脂肪酸、胆固醇的生物合成提供还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸(NADPH);为核苷酸辅酶、核苷酸的合成提供5-磷酸核糖;为芳香族氨基酸合成提供4-磷酸赤藓糖。