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文献分享 | 这些农林中药研究的组学文章思路有您可以参考的吗？

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文献分享 | 这些农林中药研究的组学文章思路有您可以参考的吗？

1034 人阅读发布时间：2021-03-06 13:43

新的学期，新的征程，BIOTREE给大家准备了农林中药的组学研究思路，助各位老师、同学梳理课题研究思路，顺利开展科学研究。

农林中药的组学研究思路主要包含生物胁迫、非生物胁迫、色泽品质、风味物质、植物疾病、生长发育、植物激素、中药活性物质、干货赠送等九部分内容，另有文献礼包赠送，欢迎各位老师文末查看资料获取方式。

1.生物胁迫篇

1. 根系分泌物驱动土壤记忆帮助植物抵御病原菌

研究对象：拟南芥

组学技术：代谢组+16S

期刊：Microbiome

影响因子：11.607

时间：2018年

研究思路：

主要结果：

生长在病原菌诱导过的处理土壤中可以提高拟南芥茉莉酸水平并且提高植物抗病性；16SrRNA基因扩增子测序表明在病原菌入侵后非根际土壤和根际土壤中微生物群落发生了改变。代谢组学结果表明被侵染后的植物会分泌更多的氨基酸、核酸和长链有机酸，但糖类物质、短链有机酸含量下降。土壤培养实验表明添加氨基酸和长链有机酸混合物提高植株抗病性。

2. 线虫信息素的植物代谢介导植物与线虫的相互作用

研究对象：拟南芥+番茄

组学技术：代谢组+代谢流+基因组

期刊：Nature Communications

影响因子：12.121

时间：2020年

研究思路：

主要结果：作者证明了蛔苷ascr#18，一种由植物寄生线虫分泌的信息素，被植物新陈代谢，产生排斥线虫和减少感染的化学信号，另外，植物编辑线虫信息素是一种与常规模式触发免疫平行的防御机制，表明植物可能主动操纵土壤有机体的化学信号。

2.非生物胁迫篇

1. 植物非生物胁迫响应与养分利用效率综述

研究对象：植物

组学技术：综述

期刊：SCIENCE CHINA Life Sciences

影响因子：4.611

时间：2020年

研究思路：

主要内容：

通过453篇文献系统的讲述了非生物胁迫因素在植物中的研究进展。

2. 代谢组学研究大豆幼苗叶片对盐胁迫的响应

研究对象：大豆

组学技术：代谢组学

期刊：PLoS ONE

影响因子：2.74

时间：2016年

研究思路：

主要结果：

代谢物组学可更全面揭示植株对环境的响应过程，包括植物机能、代谢网络、代谢调控机制和表型等均可通过对代谢物的考察进行研究。通过设置不同强度盐压力条件，考察野生大豆逐级递增的应激策略；通过与培育大豆比较，排除与耐受能力不相关的代谢变化，获得关键响应途径；通过代谢组学分析提出野生大豆的应激策略：提高相容性溶质积累量和产能途径活性。

3.色泽品质篇

1. 广泛靶标代谢组学研究大米黄变机制研究：次级代谢物分析

研究对象：大米

组学技术：植物广泛靶标代谢组

期刊：Food Chemistry

影响因子：6.306

时间：2020年

研究思路：

主要结果：

作者使用了两个稻谷品种，粳米和糯米，进行广泛靶标的代谢组学研究，比较了黄变米和相应的正常米之间的次生代谢产物差异。大米黄变后参与的通路变化（红色表示上调，绿色表示下调，灰色表示无显著差异）

2. 葡萄酒长时间陈酿过程中花青素衍生物的靶向代谢组学：进化、颜色贡献和老化预测

研究对象：葡萄酒

组学技术：代谢组学

期刊：Food Chemistry

影响因子：6.306

时间：2020年

研究思路：

主要结果：

作者利用花色苷衍生物的色泽特征和目标代谢策略来研究红酒的陈化过程。不同种类的花色苷衍生物随酒龄的变化具有不同的分布模式，吡喃花青苷(除维生素B外)比黄烷醇类(F-A和A-e-F)花色苷衍生物更稳定。葡萄酒色调的变化可能与这些化合物的比例有关，而葡萄酒的颜色密度和饱和度似乎受花青素组成变化的影响较小。

4.风味物质篇

两个品种榴莲果肉的代谢变化:阐明影响味道的代谢产物

研究对象：榴莲

组学技术：代谢组学

期刊：Food Chemistry

影响因子：6.306

时间：2020年

研究思路:

主要结果：

作者研究了泰国东部各省份常见的两种榴莲品种青尼和金枕头成熟果肉的代谢产物变化。系统地比较了两种榴莲的果实在口感和气味强度上的差异，提供了榴莲这一重要水果的代谢物组成和丰度的全面信息。结果表明，亮氨酸和半胱氨酸含量可能是造成榴莲果实香气挥发差异的原因，硫代谢相关代谢物可能影响果实软硬程度，气候或环境的差异对代谢物特征有很大影响，可能是不同年份间风味产生差异的原因。

5.植物疾病篇

1. 脂肪酸作为碳源营养在植物白fen病互作中起重要作用

研究对象：白fen病

组学技术：代谢流+遗传生物学+分子生物学

期刊：Science

影响因子：41.845

时间：2017年

研究思路：

主要结果：

作者结合稳定同位素示踪代谢流技术首次揭示了在丛枝菌根真菌与植物的共生过程中，脂肪酸是植物传递给菌根真菌的主要碳源形式，并发现脂肪酸作为碳源营养在植物白fen病互作中起重要作用。采用遗传学、分子生物学及代谢生物学的手段研究发现，植物宿主的脂肪酸合成对于丛枝菌根真菌共生是必须的，并且植物合成的脂肪酸能够直接传递给菌根真菌。

2. 番茄叶片中镰叶芹醇可以提高植物的抗病性

研究对象：番茄

组学技术：代谢组+转录组

期刊：Cell

影响因子：38.637

时间：2020年

研究思路：

主要结果：

通过转录组学和代谢组学的关联分析，筛选、锚定代谢物法卡林二醇与候选基因的关系，进而顺藤摸瓜找到关键基因簇，并确认基因簇的功能及其在病原菌互作中的作用。该研究提供了直接的生物化学和遗传学证据，证明参与代谢的新基因簇中编码的三种核心酶的相互作用，它们协调作用于法卡林二醇的生物合成，并为绘制植物中因微生物诱导而产生的高度修饰的脂类化合物的丰富化学和生物学图谱打开了大门。