代谢组学原始数据如何上传？看这条就够了！

代谢组学原始数据如何上传呢？当然是专业的事情交给专业的伙伴来共同推进啦~Metabolights数据库可以帮助大家完成数据上传，也是很多期刊推荐的代谢组学数据资料库。今天小趣就和大家分享如何将数据上传到Metabolights。

数据库网址：https://www.ebi.ac.uk/metabolights/

---

打开上面的网站后，具体操作步骤如下：

1.创建账号

2.邮箱激活账号

3.登录账号

准备工作都已做好，下面就开始正式上传数据喽~

4.创建文件

• 点击“submit study”创建文件
• 点击“create online”

• 点击“create new study”创建新研究

• 点击“Let's get started”开始

• 先选择“Yes,I would...”后点击“Next”下一步

• 点击“next”之后，文件就创建成功喽

5.页面配置

页面猛然间跳入“study description”，在页面中对应位置填写keywords、title、summary等信息。话说“字不如表，表不如图”，详细步骤如图所示哦~

接下来页面转入“sample&assay details”

6.数据上传

前期的信息准备小小的告一段落，整体上看数据上传分为以下7个内容根据实际情况，进行逐一填写信息即可啦！

第一部分：填写descriptors中的关键词和factors（如剂量）等根据实际情况填写。

第二部分：填写Protocols方法信息，包括样本收集、提取、色谱方法、质谱方法、数据转换、代谢物鉴定方法，请根据实际情况填写，示例如下：

第三部分：填写samples信息，根据实际情况增加样本，包括样本名称、物种、样本类型等信息，示例如下。如样本较多，可将表格下载填写后，重新上传，可节省时间，减少错误。

第四部分：填写Assays信息，如果是POS和NEG模式都采集了，一定记得需要独立建立两个assay。根据实际情况填写仪器类型、仪器型号、数据采集极性、scan range（在我司做的非靶代谢一般是70-1050Da）。

第五部分：填写Metabolities信息，强烈建议大家下载表格后填写后，重新上传。表格需要填写的内容可以参考我司提供定性结果的mean表格。PS：里面信息很全哦~

第六部分：填写files信息，这部分信息很重要哦——上传原始数据文件。files内的文件包含了几乎前面全部的文件，可以在这个位置下载表格填写后，和原始数据一同上传数据。

这里选择更方便“Aspera Upload”上传方式

插件安装页面弹出，按提示点击即可，安装IBM小插件，安装之后选择文件即可上传数据啦。

第七部分：这部分不需要填入信息啦，查缺补漏。如有错误按照提示进行修改，没有错误提示后，就可以提交请后台进行审核了，将“Submitted”或者“In Curation”，之后点击“OK”可以静待佳音啦。

如果遇到我们解决不了的问题，可以直接联系后台，后台邮箱：metabolights-help@ebi.ac.uk

请对方帮助解决，下图为例：

总而言之，上传数据没有想象中那么复杂，勇士们，勇往直前哦！