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成立于2013年的上海百趣生物医学科技有限公司（简称“百趣生物”）就是国内第一家专业从事代谢组学科研服务的公司。目前百趣生物已建立了完善的代谢组学平台、蛋白质组学等多组学平台。公司业务服务遍及全国各省、市地区，服务项目超2万个，年检测样品超30万例，服务的单位包括高校、研究所、医院、企业，超过1500家，其中三甲医院近300家。

直肠神经内分泌肿瘤的粪便微生物群和代谢特征

2022已过半，在这过去的半年里，BIOTREE协助客户在代谢组学、蛋白质组学和多组学等相关领域取得了骄人的成绩。据不完全统计，截至目前百趣成功助力发表文章120+篇，平均IF为9.62，最高IF=69.504，其中5分以上的就有105篇，在数量和质量上均创造了历史高点！

本文通过气相色谱-质谱（GC-MS）和液相色谱-质谱（LC-MS/MS）对粪便和血浆中的SCFAs进行定量分析，发现PD患者粪便和血浆中SCFAs水平存在差异。SCFAs与运动能力、认知能力、肠道菌群关联分析显示：粪便中低水平SCFAs、血浆中高水平丙酸与PD患者的低运动能力相关；粪便中低水平SCFAs、血浆中高水平丁酸和戊酸与较差的认知相关；PD患者部分菌群丰度的改变与血浆和粪便中SCFAs水平相关

全球近视人口比例不断增加，近视正成为现代社会的一个重要公共健康问题。目前常用的控制近视方法有行为干预、药物干预和光学干预，但这些方法都有其局限性。为寻找一种安全、易于获取的控制和预防近视方法，本文首先评估ω-3多不饱和脂肪酸(ω-3 PUFAs)作为补充剂在不同动物模型中抑制近视发展的能力，然后观察DHA和EPA对脉络膜血流量(ChBP)和巩膜缺氧的影响及对缺氧培养的人巩膜成纤维细胞(HSFs)的影响，最后研究ω-3 PUFAs补充剂对近距离工作诱导的人类健康受试者ChBP下降的影响。

代谢组学揭示肥料和农药混合使用可提高黄瓜果实品质，促进农药在果实中的消散 文章标题：Metabolomics analysis of cucumber fruit in response to foliar fertilizer and  pesticides using UHPLC-Q-Orbitrap-HRMS 发表期刊：Food Chemistry

在这过去的半年里，虽然在疫情反复无常，但是老师们并未停止科研的步伐，文章大放异彩，绽放在各大主流期刊。 BIOTREE今年协助客户在代谢组学、蛋白质组学和多组学等相关领域取得了骄人的成绩。据不完全统计，截至目前百趣成功助力发表文章110+篇，总累计影响因子1117.211，平均IF为9.8，最高IF=69.504，10分以上共28篇，在数量和质量上均创造了历史高点！文章涉及医学、微生物、动物研究等多个领域，

|低温暴露通过激活褐色脂肪组织，改变整体代谢来抑制肿瘤生长的机制，并提出了相应的恶性肿瘤治疗新思路。

肝细胞癌(HCC)是全球癌症死亡的第三大原因，5年生存率仅为50%-70%。由于缺乏早期诊断标志物，大多数HCC患者往往在晚期才会被诊断出来，预后较差。因此，迫切需要进一步了解可能的病因和新的治疗方法，以改善HCC患者的预后。 2021年8月香港中文大学于君教授在Gut（IF=23.06）又发新作，该研究对门静脉血中的代谢物变化进行了综合代谢组学分析，并与HCC患者和健康肝脏捐献者的肝组织和粪便样本中的代谢物变化进行了比较，

胆汁作为一种储存胆汁酸（BAs）的液体，已经被发现是调控健康和疾病的生化和分子基础。胆汁酸作为胆汁的主要成分（约占胆汁有机成分的50%），能通过肠道吸收脂质和脂溶性维生素到达身体几乎所有器官来调控机体代谢功能[1]（图1）。

食品微生物安全性一直是一个备受关注的课题。传统的化学防腐剂在实际应用中仍占主导地位，随着人们对微生物和化学安全食品的需求日益增加，传统的化学防腐剂正逐渐淡出研究者和消费者的视线，因此，天然产物被认为是很有前途的替代品，特别是具有生物相容性、可获取性和实用性的植物挥发性有机化合物(VOCs)，在食源性病原体和腐败生物方面被发现是有效的。

调节CAR-T细胞中的SOCE-钙调神经磷酸酶-NFAT通路和糖酵解途径使它们能够抵抗衰竭，从而产生具有增强抗肿瘤效力的CAR产品。

四川大学华西医院王刚教授是论文第一通讯作者，刘影博士是论文第一作者；上海百趣代谢组学技术研究中心创始团队刘志鹏研究员和研究人员王洪光为论文共同作者。百趣生物为本次研究提供了非靶向代谢组学+靶向代谢组学服务。

该研究建立了ONT三代测序和Illumina二代测序数据混合组装的新方法（图1a），检测出了更多包括插入突变、缺失突变和基因倒位在内的结构变异（structural variations, SVs）。同时，通过对100个人组成的健康人群横断面队列和由10个人组成的纵向跟踪队列的宏基因组学和代谢组学的联合分析，发现了SVs在不同个体间存在明显不同，但在同一个体内有相对稳定，同时也发现SVs不仅影响菌群与代谢物的功能，对人体表型也有一定影响。

为了应对这一挑战，更好地理解健康衰老的代谢机制，我们开发了一种全基因组精确代谢建模(GPMM)方法，该方法能够定量整合转录组、蛋白质组和运动学组数据，在代谢网络预测建模中。基准分析表明，GPMM成功地表征了NCI-60细胞株的特征代谢重编程;与现有方法相比，预测和实验测量之间的R2为0.86，极大地改善了建模的性能。

慢性肾脏病（CKD）是一个全球性的公共卫生问题，也是导致死亡的主要原因之一。然而，CKD的发病机制和干预方法尚不完全清楚。因此，一些创新的组学技术被用来研究CKD的发病机制和可能的治疗靶点，包括蛋白质组学和代谢组学，以减缓CKD的进展。

百趣代谢组学实验室分享：细胞培养也叫细胞克隆术。是指在体外模拟体内环境（无菌、适宜温度、酸碱度和一定的营养条件等），使细胞生存、生长、繁殖并维持主要结构和功能的一种方法。小趣刚刚接触细胞的时候很慌，每天小心翼翼，生怕哪天它一不高兴就给我“脸色”看。经过多年摸爬滚打，小趣终于成长为一名合格的细胞培养技术员，哈哈！今天，就和大家来聊一聊细胞培养的基本流程。

瀑布图是一种用于展示拥有相同的X轴变量数据、不同的Y轴离散型变量和Z轴数值变量的专业绘图，它可以清晰地展示不同样本对同一差异蛋白的变化关系。

三阴性乳腺癌(TNBC) 是一种侵袭性疾病，预后差，免疫治疗在患者中取得的成功有限。三阴性乳腺癌(TNBC)的四种亚型中，IM亚型的特点是在微环境中富集免疫激活细胞和免疫刺激因子，提示TNBC的IM亚型患者可能对免疫治疗有更好的反应。因此，迫切需要找到调节TNBC微环境、促进抗肿瘤免疫的因子。本研究对FUSCCTNBC队列（n=360）的转录组、代谢组和微生物组数据进行了全面分析，发现TMAO通过诱导肿瘤细胞焦亡，从而增强TNBC体内CD8+T细胞介导的抗肿瘤免疫，提高免疫治疗疗效。该研究为微生物群-代谢-免疫相互作用提供了新的见解，并表明微生物代谢物，如TMAO或其前体胆碱，可能代表了一种新的治疗策略，以促进免疫治疗对TNBC的疗效。

细胞培养